「ほかに命令は・・・？」「・・・死ぬな、必ず生き延びろ。以上だ」

【2話収録】
■第23話「善悪の彼岸　EQUINOX」
　＜笑い男事件＞とその黒幕・薬島幹事長とを結びつける最後の線、セラノゲノミクス。９課が動き出した矢先、青いフードをかぶった人物が瀬良野社長宅を訪れる。＜笑い男事件＞の発端となった６年前の誘拐事件が、今まさに再現されようとしていた。
■第24話「孤城落日　ANNIHILATION」
　薬島幹事長を逮捕するため総理と掛け合う荒巻。だが、既に９課壊滅のシナリオが動き出した後だった。特殊部隊規制法案の施行、そして本部の武力制圧。草薙は９課の「解散」を宣言し、それぞれに逃走・潜伏することを命じるのであった。

製作年度：2002

第23話　脚本：藤咲淳一／演出・絵コンテ：松本 淳／作画監督：中村 悟
第24話　脚本：櫻井圭記／演出：下司泰弘／絵コンテ：橘 正紀／作画監督：浅野恭司

原作・協力：士郎正宗／企画：石川光久、渡辺 繁／監督・シリーズ構成：神山健治／キャラクターデザイン：下村 一／メカニカルデザイン：寺岡賢司、常木志伸／美術監督：竹田悠介／美術設定：加藤 浩／色彩設定：片山由美子／特殊効果：村上正博／編集：植松淳一／撮影監督：田中宏侍／3D監督：遠藤 誠／音響監督：若林和弘／音楽：菅野よう子／制作：Production I.G／製作：攻殻機動隊製作委員会（Production I.G、バンダイビジュアル、BANDAI ENTERTAINMENT,INC.、電通、ビクターエンタテインメント、日本テレビ、徳間書店、MANGA ENTERTAINMENT,INC.）　他

草薙素子：田中敦子／荒巻大輔：阪 脩／バトー：大塚明夫／トグサ：山寺宏一／イシカワ：仲野 裕／サイトー：大川 透／バズ：小野塚貴志／ボーマ：山口太郎／タチコマ：玉川紗己子　他