反統合同盟に捕らわれたシンとサラ､そしてアリエス。渦巻く激戦と陰謀の中“鳥の人”がついに目覚め始める…。

【1話収録】
■第四章「密林」
　 1999年、地球に落下した異星人の宇宙戦艦をめぐり、地球統合戦争が勃発。開戦から８年が経過し、ベテランパイロットたちが次々と失われていった時代。統合軍の青年パイロット、工藤シンと、マヤン島の巫女、サラ・ノームの２人は、密林で反統合同盟のノーラ部隊によって捕らわれの身となってしまう。そして、アリエスもまた同じくして、反統合同盟のアジトへと連行されてしまう。そこで３人はアリエスの恩師でもあるハスフォード博士と出会い、ハスフォードこそが、反統合同盟の黒幕であもり、指導者であることを知る。過去のトラウマに怯えるサラと、不信感を抱くアリエス。そんな２人にハスフォードは"鳥の人"の伝説を語り始める。
　一方、マヤン島上空では、VF-０Sを操縦する統合軍パイロット、ロイ・フォッカーと反統合同盟パイロット、D・Dイワノフが再び宿命の対決を繰り広げていた。
　渦巻く陰謀と激戦の中、運命の鍵を握るプロトカルチャーの遺跡"鳥の人"が目覚め始める…。

製作年度：2002

原作・監督・メカデザイン：河森正治／脚本：大野木 寛／キャラクターデザイン：齋藤卓也／音楽：蓜島邦明／特技監督：板野一郎／メカニックデザイン：石垣純哉・宮武一貴／美術監督：太田 大／美術設定：平沢晃弘／メカニックアート：天神英貴／色彩設計：海鉾重信／音響監督：三間雅文／編集：竹内康晃／撮影監督：前田洋志／アニメーション制作：サテライト／製作・著作：ビックウエスト・バンダイビジュアル　他

工藤シン：鈴村健一／サラ・ノーム：小林沙苗／マオ・ノーム：南里侑香／アリエス・ターナー：進藤尚美／イワノフ：大友龍三郎／ノーラ・ポリャンスキー：高山みなみ／Dr.ハスフォード：野沢那智／ロイ・フォッカー：神谷 明　他